Veggli kirke er kan hende ingen turistattraksjon på linje med stavkirken, men bakom et lite spektakulært ytre finner vi likefullt et vakkert og intimt kirkerom. Også i Veggli sto det en middelaldersk stavkirke frem til 1861. Denne ble da revet, og materialene solgt på auksjon. Den lille, trange og mørke stavkirken ble erstattet av rikelig med lys og luft av den kjente arkitekten Chr. H. Grosch.
Det var Ole Sjulsen Fjøslien Rostad – ”som den i Præstegjældet mest bygningskyndige Mand” – som var byggmesster, og han fulgte stort sett Grosch sine tegninger. Tidligere hadde han stått for den store ombyggingen av Rollag prestegård i 1840 og lagt nytt tak på Rollag stavkirke. I 1850 bygde han Dagali kirke. Formann i byggekomiteen var Per Glaim fra Gladheim i Veggli. Han fikk beholde nøkkelen til gamlekirken da den ble revet, og denne nøkkelen er fortsatt i gårdens eie.
Den nye kirken ble antagelig vigslet første søndag i advent 1859. Da begynte de messen i stavkirken, før de gikk i prosesjon og bar over inventaret fra den gamle til den nye. En god del av inventaret i dagens kirke stammer fra den gamle stavkirken. Klokkene, døpefonten og en kiste er fra middelalderen. Nattverdskalk og lysestaker er fra 1700-tallet; det samme er brudebenken og almissetavlen som er utskåret av den kjente treskjæreren Iver Øvstrud. Den gamle altertavlen (1763) henger nå på sydveggen i koret og viser det siste måltid. Ifølge innskriften på baksiden er den laget av Ezechiel von Dram og donert av Knud Veggli og Tollef Kjemhus.
Opprinnelig var kirkerommet helt åpent. Skilleveggene mellom koret og sidesakristiene var ikke mer enn ca. 3 meter høye, og sakristiene hadde ikke himling. I 1940 ble det gjort store endringer etter tegning fra arkitekt Tormod Hustad. Sakristiene fikk himling og skilleveggene ble først helt opp til taket. Koret fikk den spissbuede tre-hvelvingen det har idag, og åpningen til koret fikk korresponderende overdekning. Veggene i kirken ble malt i mørk gråblå farge. 1 1967 ble fargene tilbakeført til de opprinnelige lyse fargene vi ser idag.
Noe som særmerker Veggli kirke sammenlignet med mange landsens sognekirker er den flotte altertavlen, tydelig inspirert av altertavlen i Rollag og perfekt dimensjonert til østveggen i koret. Kunstneren, Sigurd Førde, var sogneprest i Rollag 1917-1928, da han ble avsatt. I en årrekke arbeidet han på denne altertavlen som ble som et livsverk for ham. Han har også skåret ut lysestakene i koret. En større mengde skisser og utkast som nå oppbevares på kirkekontoret gir et interessant innblikk i det møysommelige tankearbeidet og planleggingen bak et slikt storverk.
Det sentrale motivet i altertavlen er noe uvanlig: Nikodemus som kommer til Jesus om natten og samtaler med ham. Altertavlen minner oss om at selv for de mest utstøtte og skamfulle går det an å komme til Jesus, om det så er i hemmelighet, om natten, sette seg rolig ned ved hans føtter og ta imot hans nåde.
Det siste tiåret har Veggli menighetsråd lagt ned et stort arbeid og fått til mye. 2. påskedag 2007 ble de åtte ikonene som pryder prekestolen innviet. De er malt av Kjellaug Nordjsø. Til 150-årsjubileet i 2009 kom det nye antependier til prekestol og lesepult i alle fire kirkeårsfarger. Disse var lagd av Monica Kongsjorden på Monicas stoppested. Hun har også trukket om alterringen og brudestolene, og trukket de nye benkene.
Det største prosjektet i denne perioden var å få nye benker til kirken. I utgangspunktet ønsket menighetsrådene å bytte ut de originale, men akk så vonde benkene med stoler, noe de ikke fikk tillatelse til fra Riksantikvaren. Løsning nr. to var å få nye, mer behagelige benker som lignet mest mulig på de opprinnelige. Etter en god del om og men, som blant annet inkluderte en midlertidig fredning, sto de nye benkene klare i 2011.
De senere årene er Veggli kirke særlig preget av å være åsted for mye av menighetens barnearbeid. Den utforskes av tårnagenter, brukes som overnattingssted av lys våken-deltagere og er ikke minst scene under Nume TweenSings minimusikal hver vår. "Sprell levende-messene" er messer spesielt tilrettelagt for barn. Også disse feires som regel i Veggli kirke. 